慢性扁桃体炎的主要症状是反复发作急性扁桃体炎,也有部分患者无明显急性发作史。表现为经常咽部不适,异物感,发干,痒,刺激性咳嗽,口臭等症状。儿童过度肥大的扁桃体可引起呼吸、吞咽、语言障碍。若伴有腺样体肥大可引起鼻塞、鼾声及卡他性中耳炎症状。由于经常咽下分泌物及隐窝中的细菌毒素,可致消化不良,头痛,乏力、低热等症状。

临床上为记录方便,可将扁桃体的外形大小分为ⅲ度:扁桃体超出舌腭弓,但未遮盖咽腭弓者为ⅰ度;已遮盖咽腭弓者为ⅱ度;超出咽腭弓突向中线者为ⅲ度。但扁桃体的大小不能作为炎症的指征,因为儿童有生理性肥大,成人多萎缩。